Des noms utilisés dans cet article proviennent d'une traduction non officielle du nom japonais des monstres. Les noms sont obtenus soit en utilisant des traducteurs ou car il existe des termes équivalents en Anglais/Français dans les précédents opus déjà traduits.
Une sous-espèce est une version alternative d'un monstre. Ces monstres sont habituellement nommés pour leur nouvelle couleur, par exemple le Yian Kut-Ku Bleu est une sous-espèce du Yian Kut-Ku. Les sous-espèces sont généralement presque identiques à leurs monstres originaux, car, après tout, ils sont de la même espèce. Cependant, ils possèdent généralement une meilleure santé ou endurance et des faiblesses altérées qui les rendent plus difficiles à combattre.
Les sous-espèces ont la plupart du temps de nouveaux mouvements, comme les attaques de foudre du Fatalis Blanc par exemple, ou les projectiles glacés du Najarala du Déluge. Certaines sous-espèces ne sont en fait différentes que par les caractéristiques physiques, telles que la barbe et la pointe de cheveux en plus sur le Congalala Emeraude.
Les sous-espèces, bien que pouvant être rencontrés dans les même endroits que leur espèces d'origines, vivent généralement, voir exclusivement pour certains, dans des envirronements différents et/ou totalement opposés à ceux de leur espèces d'origine, comme pour le Zamtrios et le Duramboros avec leur sous-espèces respectives, le Zamtrios Tigré et le Duramboros Rouillé, qui vivent tout deux dans un evironnement desertique, alors que leur espèces d'origines respectives vivent respectivement dans un envirronement polaire et tropical. Cela s'explique par un phénomène évolutif, en lien avec la barrière naturel que devient l'envirronement. En effet, lorsqu'une espèce arrive dans un nouvel écosystème, elle s'adapte et subit des mutations génètiques naturelles dût au hasard, jusqu'à devenir une nouvel espèce à part entière. Chaque espèce passe par la case de la sous-espèce pour passer à une autre complètement. De part le fait, ces sous-espèces, dont les ancètres était des groupes de monstres normaux de l'espèce d'origine, et qui sont des groupes assez conséquent pour se maintenir en vie, sont des individus qui, sans se mélanger aux monstres normaux, sont actuellement en train "d'évoluer". L'évolution prenant normalement des centaines de millions d'années, il faudra du temps avant que ces sous-espèces deviennent des espèces a part entière, diférentes de leur espèce d'origine.
Parfois, une sous-espèce peut également être considérée comme une espèce «rare», et inversement, ce qui est le cas pour la Rathian d'or, le Rathalos d'argent ( les deux sont de la même espèce), le Nargacuga Sélénite... Ces monstres (qui sont des vrai espèces a part entières et non des sous-espèces) sont normalement beaucoup plus puissants que leurs homologues d'origine, mais aussi beaucoup plus rares, d'oû la confusion.
Attention cependant, certaine monstres considéré comme des sous-espèce ne le sont pas vraiment et peuvent être juste des variantes ou une version adulte de ce dernier. Par exemple, contrairement à la croyance locale, le Khezu rouge (ou pourpre) est simplement le véritable Khezu qui lui, est simplement un Khezu albinos. Ces monstres seront toutefois comptabilisé comme telle dans la liste ci-dessous (afin d'éviter toutes confusion) mais ils seront notifiés et expliqués dans la section "A Noter" tout à la fin.
Les sous-espèces se distinguent des variantes de par le fait qu'ils sont assez nombreux pour faire des groupes assez conséquent d'individus rassemblant les même caractéristiques et qu'il y a des barrière naturels les empêchant de se mélanger avec les monstres normaux.
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